Itä-Suomen aluehallintovirasto sovittaa yhteen poikkeusoloihin varautumista huolehtimalla sen edellyttämän yhteistoiminnan järjestämisestä. Aluehallintovirasto järjestää eri toimijoiden yhteistoiminta- ja valmiusharjoituksia. Virasto tukee kuntien valmiussuunnittelua sekä edistää alue- ja paikallishallinnon turvallisuussuunnittelua.
Itä-Suomen aluehallintoviraston vastuualueet osallistuvat yhteiskunnan elintärkeiden toimintojen turvaamiseen (YETT) yhteistyössä elinkeino-, liikenne- ja ympäristökeskusten sekä muiden viranomaisten kanssa.